ChemScript mit Python (Schulung | Friedrichsdorf)

In der Schulung werden die Grundlagen der Programmierung mit Python vermittelt, mit dem Ziel, selbstständig Skripte für ChemScript zu erstellen bzw. zu verändern. Der Kurs richtet sich an Chemiker*innen, die ihre immer wiederkehrenden Arbeitsvorgänge in der ChemOffice-Suite gerne automatisieren möchten.

Kursinhalte

1. Teil

Python als Programmiersprache

• Was ist Python? Überblick und Entwicklungsumgebung
• Syntax, Datentypen und Zeichenketten, Operatoren
• Sets, Listen, Tupel und Dictionaries
• Kontrollstrukturen: bedingte Anweisungen und Schleifen
• Errors und Exceptions
• Dateiverarbeitung: Input und Output von Dateien
• Funktionen erstellen
• Eine GUI programmieren/verwenden

ChemScript als Erweiterung der ChemDraw-Produktfamilie

• Was ist ChemScript?
• Laden des Moduls, Einbindung weitere Bibliotheken
• Objekte erstellen oder einlesen mit ChemScript
• Strukturen bereinigen
• SD-Dateien einlesen und in ChemDraw-Dateien umwandeln
• Structure-to-Name und Name-to-Structure verwenden
• 2D- und 3D-Strukturen erstellen
• SMILES und InChI verwenden

2. Teil

Praxisbeispiele verstehen, erstellen, anpassen

• „Standalone“ ChemScripts
  • Konvertieren
  • Detektieren
  • Suchen nach funktionellen Gruppen
  • Beispiel für GUI-Anwendungen
• „Add-On“ ChemScripts in ChemDraw
  • Dendrimer-Generierung
  • selektierte ChemDraw-Struktur im „ChemSpider“ suchen
  • „Maximum Common Substructure“ berechnen
  • Tanimoto-Abstand berechnen
  • Test auf Chiralität, Identität, Substrukturrelation, Tautomerie
  • Einbindung externer API-Funktionen (u. a. Mathematica)

Eventdatum: Dienstag, 14. Mai 2024 09:00 – 12:30

Eventort: Friedrichsdorf